一个神社的少女日暮戈薇，是最普通的初三学生。由家中的井到了500年前的战国时代，在那里解开了被封印的半妖——犬夜叉的封印。

犬夜叉为了成为完全的妖怪而想要得到四魂之玉。四魂之玉变成碎片飞散四处。他们为了寻找四魂之玉的碎片和妖怪们战斗的旅程开始了……

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